上海传染科三乙医院排行榜排名靠前的医院有复旦大学附属华山医院、瑞金医院、上海市肺科医院、上海市公共卫生临床中心,榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。其中复旦大学附属华山医院是全国传染感染医院排行榜第1位、瑞金医院是全国传染感染医院排行榜第5位、上海市肺科医院是全国结核病医院排行榜第2位、上海市公共卫生临床中心是全国结核病医院排行榜第4位。

全国传染感染医院排行榜第1名:复旦大学附属华山医院创建于1907年，是国家卫生计生委委属医院、复旦大学附属教学医院和中国红十字会冠名的医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，是国内最著名、最具国际化特征的医教研中心之一。

全国传染感染医院排行榜第5名:瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，有着百年的深厚底蕴。医院占地面积12万平方米，建筑面积30万平方米，绿化面积4万平方米。

全国结核病医院排行榜第2名:同济大学附属上海市肺科医院（上海市职业病防治院）创建1933年，现已发展成为集医疗、教学与科研功能为一体的现代化三级甲等专科教学医院，连年跻身全国医院排行榜百强。医院连续获得“上海市文明单位”称号。

全国结核病医院排行榜第4名:上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心（简称“公卫中心”）是复旦大学附属三级甲等医院、又名复旦大学附属中山医院南院；全国传染病医师进修教育培训基地、上海市疾病控制中心临床基地。