全国治疗小儿系统性红斑狼疮比较好的三甲医院包括北京协和医院、北京大学人民医院、上海交通大学医学院附属仁济医院、南京鼓楼医院、华西医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。北京协和医院是全国风湿病医院排行榜第1位、北京大学人民医院是全国风湿病医院排行榜第2位、上海交通大学医学院附属仁济医院是全国风湿病医院排行榜第3位、南京鼓楼医院是全国风湿病医院排行榜第4位、华西医院是全国风湿病医院排行榜第5位。

全国风湿病医院排行榜第1名:北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担干部保健和外宾医疗任务的医院之一，在国家三级公立医院绩效考核中两次排名第一。

全国风湿病医院排行榜第2名:北京大学人民医院集医疗、教学、科研、保健为一体的现代化综合性三级甲等医院，是国家卫生健康委员会委管医院，北京大学附属医院，北京大学第二临床医学院；同时也是首批国家疑难病症诊治能力提升工程项目组长单位。

全国风湿病医院排行榜第3名:上海仁济医院建于1844年,是上海开埠后第一所西医医院。医院目前由东西南北四个院区和上海市肿瘤研究所组成,是一个学科门类齐全,集医疗、教学、科研于一体的综合性三级甲等医院。

全国风湿病医院排行榜第4名:南京鼓楼医院（南京大学医学院附属鼓楼医院），建于1892年，为中国最早的西医院之一，鼓楼医院目前已发展成为学科门类齐全、师资力量雄厚、医疗技术精湛、科研实力较强的大型研究型综合性三级甲等医院。

全国风湿病医院排行榜第5名:四川大学华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。