全国心理咨询科医院排行榜排名靠前的医院有北京大学第六医院、上海市精神卫生中心、中南大学湘雅二医院、华西医院、北京安定医院,榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。其中北京大学第六医院是全国精神医学科医院排行榜第1位、上海市精神卫生中心是全国精神医学科医院排行榜第2位、中南大学湘雅二医院是全国精神医学科医院排行榜第3位、华西医院是全国精神医学科医院排行榜第4位、北京安定医院是全国精神医学科医院排行榜第5位。

全国精神医学科医院排行榜第1名:北京大学第六医院是北京大学精神病学与精神卫生学的临床医疗、人才培训与科学研究基地，是世界卫生组织(WHO)北京精神卫生研究和培训协作中心，也是中国疾病预防控制中心的精神卫生中心。

全国精神医学科医院排行榜第2名:上海市精神卫生中心始建于1935年，前身为上海普慈疗养院，院址位于上海市西南郊区（现闵行区），由慈善家陆伯鸿集资建设，属教会管理，是当时远东最大、设备最完善的精神科专科医院之一。

全国精神医学科医院排行榜第3名:中南大学湘雅二医院（原湖南医科大学附属第二医院）位于历史名城，湖南省会长沙，脱胎于1906年美国雅礼协会在中国创办最早的西医院之一——雅礼医院，始建于1958年，是一所卫生部直属的大型三级甲等医院。

全国精神医学科医院排行榜第4名:四川大学华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。

全国精神医学科医院排行榜第5名:首都医科大学附属北京安定医院创建于1914年，2000年成为首都医科大学精神卫生学院，也是全国第一所精神卫生学院，是精神病和精神卫生专业的硕士点、博士点以及应用心理学硕士点。