赣南医学院第三附属医院原名南昌铁路局赣州医院，创建于1996年7月，是江西省目前唯一独立设置普通本科西医院校—赣南医学院直属附属医院之一。医院座落于京九明珠赣州火车站旁，位于五洲大道与京九路交叉路口，交通便利，环境幽雅，是一所学科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研于一体的综合性医院。

赣南医学院第三附属医院占地面积22830.25㎡，医疗用房11000㎡，现有病床数110张。医院开设内科、外科、妇产科、儿科、中医科、口腔科、五官科和皮肤科等临床科室，并在铁路沿线设有6个卫生所。医院以骨创伤外科、腔道泌尿外科及腹腔镜外科和风湿专科等为特色专科，其中骨创伤外科、泌尿外科能常规开展三甲医院各种专业技术项目手术。

赣南医学院第三附属医院现有职工160人，其中卫生技术人员130人，高、中级专业技术人员30余人，硕士生导师1人，江西省卫生厅跨世纪学科带头人1人，1人入选江西省新世纪千百万人才工程。

赣南医学院第三附属医院医疗设备齐全，拥有诸多国际先进设备，如：德国产大功能钬激光碎石机、英国产超脉冲等离子前列腺电切镜、美国史赛克腹腔镜、关节镜、德国产全套泌尿腔镜德国蛇牌骨科动力系统、意大利VILLAC2000型C臂机、进口床边X光机等专科设备；还有美国产全身CT、GE彩超等先进的诊疗设备，价值达2000余万元。