深圳市宝安区中医院始建于1988年。2012年经深圳市卫生和人口计划生育委员会批准加挂“深圳市第三中医院”牌子。医院经过25年的建设与发展，各项工作取得了长足的进步。现已成为集医疗、预防、保健、教学、科研为一体的国家三级甲等中医医院(是广东省首家通过国家三级甲等中医医院评审的区县级中医医院)、广东省中医名院(全省共11家，唯一一家区县级中医院)、广州中医药大学非直属附属医院、广州中医药大学研究生培养基地、广东省中医药养生文化旅游示范基地、广东省百家文明医院、深圳市社会保险定点医疗机构信用等级AAA单位、全国第二批中医医院中医药文化建设试点单位、全国第三批治未病预防保健服务试点单位和广东省中医治未病试点单位。

医院编制病床400张，开设临床科室22个，医技科室10个，社区健康服务中心6个。拥有省中医名科1个，省级中医特色专科3个，市级医学重点专科1个，市级中医特色专科5个，宝安区医学重点专科2个。省级示范社康中心1个，市级示范中医药社康中心2个。拥有12类40种233台套中医诊疗设备以及6层螺旋CT机等50万元以上设备14台套。能开展三级甲等中医医院的所有诊疗项目，部分诊疗项目已达国内领先水平。2006年以来，年业务增长率达到30%以上。

医院现有职工701人，其中博士后1名，博士9名，硕士58名，高级职称113人，省级名中医3名，硕士生导师10名。2006年以来，主持各级科研立项139项，其中民政部课题1项，省科技厅课题1项，广东省自然科学基金课题1项，省中医药管理局课题32项，市级科研课题18项(其中重大科研课题2项)，区级科研课题77项。获国家级专利2项;发表学术论文593篇;出版专著12部;科研结题70项，占应结题课题的100%;科研成果登记4项;获省级科技进步奖、中华中医药学会科学技术奖、市级科研成果、宝安区科技进步奖、中华中医药学会学术著作奖各一项。2005年起连续8年荣获深圳市医疗服务质量整体评估区级中医院第一名，2010年荣膺宝安区区长质量奖。2012年荣获深圳市市长质量奖鼓励奖。

医院发展赢得群众信赖、同行认可和政府肯定。2009年来先后有中国政府援非项目“医院建设与医院管理”培训班的29名非洲14国卫生官员以及内蒙古自治区卫生厅、江西省卫生厅等全国各省、市同行共50多批近600人次来院参观学习。当前，医院借国家重视发展中医药事业、广东省继续推进建设中医药强省及宝安区委区政府高度重视卫生事业发展的强劲东风，正努力创建全国示范中医院、全国中医名院。