巴州区妇幼保健院始建于1951年，是集医疗、预防保健、教学、科研、执法监督指导于一体的综合性医疗保健机构，履行为全区妇女儿童提供“八大”公共卫生和基本医疗服务的职能，是国家“二级甲等妇幼保健院”、“巴州区孕产妇急救中心”，“市级最佳文明单位”、“省级卫生单位”、“省级青年文明号”，是全区医保、社保及生育保险定点医疗机构。2013年全国妇联授予“两癌筛查先进单位”，并批准增冠巴中市巴州区妇女儿童医院。2015年被四川省总工会授予“四川省三八红旗集体”，顺利通过国家级爱婴医院复评。

巴州区妇幼保健院现有职工141人（在编49人），其中卫生技术人员118人，其中高级职称14人、中级职称25人。开设床位62张。拥有进口宫腹腔镜、人体成份分析仪、高分辨率进口彩超、时间分辨荧光免疫分析仪、全动生化分析仪、尿液分析仪、全血图、血凝仪、微量元素测定仪、骨密度、麻醉机、心电监护仪、胎儿监护仪、新生儿恒温培养箱、儿童智力测评仪、儿童保健测评系统等医疗设备。设有行政办公室、支部办公室、医务科、护理部、保健部、院感科、财务科、后勤设备科、信息管理科、婚保计生部10个职能科室。开设有妇科、产科、儿科、新生儿科、妇女保健科、检验、超声、孕产期保健中心、生殖保健、不孕症诊治、儿童保健、儿童智力测试、听力视力筛查、婴幼儿水疗抚触、产后康复等20个临床保健科室。