会泽县中医院始建于1957年3月，是全省建院最早的县级中医医院。2009年在有关部门的大力支持下，开始筹建新中医医院，经过几年的努力，于2012年12月医院整体撤迁至会泽县通宝路771号。2018年3月购置云南驰宏锌股份有限公司会泽分公司综合业务办公区作为医院的业务用房，目前医院占地面积约122亩，业务用房27620平方米。于2014年6月20日由国家中医药管理局正式授予“二级甲等中医医院"牌匾。2018年10月云南省卫生和计划生育委员会正式批复了会泽县中医医院关于申请晋升为三级中医医院的请示，现已按三级中医医院标准建设。