子洲县中医院位于县城中心大理路33号，是县内唯一一所中西医结合的综合医院。总建筑面积15000平方米，现有职工204人，专业技术人员170人，其中高级技术职称13人，中级职称26人。开放床位200张，有行政、后勤、医技、临床科室30余个，妇科、儿科、内科、外科、肛肠科、中医科诊疗居同级医院领先水平。2015年门诊人次63272，住院7339人次。医院配有层流标准手术室，中心供氧，中心呼叫系统；自动中药颗粒机实现了智能化抓药，2015年与省残联合作，成立了南六县残疾人康复中心。

现有东芝螺旋CT、数字化X线摄影系统（DR）、德国狼牌腹腔镜及全自动生化分析仪、碳14幽门螺旋杆菌检测仪、骨密度检测仪等先进医疗设备，并与金域公司外送可完成全部化验项目（肿瘤系列、激素系列等）达到市级医院同等水平。